信息安全保护分级、分区域、分类、分阶段是做好国家信息安全保护应遵循的准则。国家信息安全等级保护与涉密信息系统分级保护是两个既联系又有区别的概念。国家安全信息等级保护，重点保护的对象是非涉密的涉及国计民生的重要信息系统和通信基础信息系统；涉密信息系统分级保护是国家信息安全等级保护的重要组成部分，是等级保护在涉密领域的具体体现。
等级保护和分级保护之间的关系
国家信息安全等级保护与涉密信息系统分级保护是两个既有联系又有区别的概念。涉密信息系统分级保护是国家信息安全等级保护的重要组成部分，是等级保护在涉密领域的具体体现。
国家安全信息等级保护重点保护的对象是涉及国计民生的重要信息系统和通信基础信息系统，而不论它是否涉密。如：
(1) 国家事务处理信息系统（党政机关办公系统）；
(2) 金融、税务、工商、海关、能源、交通运输、社会保障、教育等基础设施的信息系统；
(3) 国防工业企业、科研等单位的信息系统；
(4) 公用通信、广播电视传输等基础信息网络中的计算机信息系统；
(5) 互联网网络管理中心、关键节点、重要网站以及重要应用系统；
(6)其他领域的重要信息系统。
国家实行信息安全等级保护制度，有利于建立长效机制，保证安全保护工作稳固、持久地进行下去；有利于在信息化建设过程中同步建设信息安全设施，保障信息安全与信息化建设相协调；有利于突出重点，加强对涉及国家安全、经济命脉、社会稳定的基础信息网络和重要信息系统的安全保护和管理监督；有利于明确国家、企业、个人的安全责任，强化政府监管职能，共同落实各项安全建设和安全管理措施；有利于提高安全保护的科学性、针对性，推动网络安全服务机制的建立和完善；有利于采取系统、规范、经济有效、科学的管理和技术保障措施，提高整体安全保护水平，保障信息系统安全正常运行，保障信息安全，进而保障各行业、部门和单位的职能与业务安全、高速、高效地运转；有利于根据所保护的信息的重要程度，决定保护等级，防止“过保护”和“欠保护”的情况发生；有利于信息安全保护科学技术和产业化发展。
涉密信息系统分级保护保护的对象是所有涉及国家秘密的信息系统，重点是党政机关、军队和军工单位，由各级保密工作部门根据涉密信息系统的保护等级实施监督管理，确保系统和信息安全，确保国家秘密不被泄漏。国家秘密信息是国家主权的重要内容，关系到国家的安全和利益，一旦泄露，必将直接危害国家的政治安全、经济安全、国防安全、科技安全和文化安全。没有国家秘密的信息安全，国家就会丧失信息主权和信息控制权，所以国家秘密的信息安全是国家信息安全保障体系中的重要组成部分。
因为不同类别、不同层次的国家秘密信息，对于维护国家安全和利益具有不同的价值，所以需要不同的保护强度种措施。对不同密级的信息，应当合理平衡安全风险与成本，采取不同强度的保护措施，这就是分级保护的核心思想。对涉密信息系统的保护，既要反对只重应用不讲安全，防护措施不到位造成各种泄密隐患和漏洞的“弱保护”现象；同时也要反对不从实际出发，防护措施“一刀切”，造成经费与资源浪费的“过保护”现象。对涉密信息系统实行分级保护，就是要使保护重点更加突出，保护方法更加科学，保护的投入产出比更加合理，从而彻底解决长期困扰涉密单位在涉密信息系统建设使用中的网络互联与安全保密问题。
由上可以看出国家信息安全等级保护是国家从整体上、根本上解决国家信息安全问题的办法, 进一步确定了信息安全发展的主线和中心任务, 提出了总体要求。对信息系统实行等级保护是国家法定制度和基本国策，是开展信息安全保护工作的有效办法，是信息安全保护工作的发展方向。而涉密信息系统分级保护则是国家信息安全等级保护在涉及国家秘密信息的信息系统中的特殊保护措施与方法。由于国家秘密信息与公开信息在内容和特性上有着明显的区别，所以涉密信息系统和公众信息系统在保障安全的原则、系统和方法等方面也有不同的要求。既不能用维护国家秘密信息安全的办法去维护国家公众信息安全，以至于影响信息的合理利用，阻碍信息化的发展；也不能用维护公众信息安全的办法来维护国家的秘密信息安全，以至于窃密、泄密事件的发生，危害国家的安全和利益，同样影响信息化的健康发展。